Сама вселенная сталкера это научная фантастика, и мистика кардинально идет с ней вразрез. В трилогии любые галлюцинации объяснялись воздействием источниками из вне, зачастую пси-воздействие вызывающее общие галлюцинации (действующие пси-установки, контролеры). Редкое исключение когда я видел что люди играли что-то подобное в результате условной лучевой болезни.
Если кроме мистики и нашествия кабанов ивентеру нечего предложить игроку - это сугубо его проблема и ограничение фантазии. Хотите играть призраков - есть куча моментов, с точки зрения которых можно объяснить их наличие.